¿De qué se trata este curso?

Este curso está pensado para personas que ya usan Google Earth Engine (GEE) y quieren empezar a usarlo desde R o bien que quieren iniciarse en el uso de GEE y el paquete rgee.

Veremos conceptos básicos de datos espaciales, los paquetes disponibles en R para trabajar con este tipo de datos y nos enfocaremos en el paquete rgee para el uso de Google Earth Engine desde R.

Los materiales presentan un video con el taller completo, incluyendo conceptos teóricos y práctica con código.

El taller fue dictado como un seminario web para Desafíos AgTech 2020

Antes de empezar

Google Earth Engine

Necesitamos que te registres en la herramienta para poder utilizarla durante el curso, para ello debes entrar en este link:

https://signup.earthengine.google.com/

R y RStudio

Asumimos que tenes instalado R y RStudio, si no es así seguí estas intrucciones que Paola Corrales y Elio Campitelli escribieron de forma tan clara.

Paquetes de R para trabajar con datos espaciales

Vas a tener que instalar una serie de paquetes que te permiten trabajar con datos espaciales, algunos los usaremos durante el seminario web.

Paquetes para trabajo con datos

install.packages("tidyverse")

Paquetes para trabajo con datos espaciales: r-spatial

install.packages("sf") # para trabajar con datos vectoriales y rgee depende de sf
install.packages("raster") # para trabajar con datos raster.
install.packages("mapedit") #para trabajar con mapas interactivos.
install.packages("tmap") # para generar mapas temáticos.

Paquetes para trabajo con GEE

Para instalar rgee desde GitHub ejecutar este código de R:

remotes::install_github("r-spatial/rgee")

Si el código anterior te da error puede ser que necesites instalar la librería remotes

install.packages('remotes')

y luego puedas ejecutar remotes::install_github('r-spatial/rgee') sin problemas.

Es necesario instalar miniconda para que rgee funcione. La función ee_intall() se encarga de esta tarea. Se ejecuta solamente una vez.

library(rgee)  # cargamos el paquete rgee
ee_install() # pedimos que instale miniconda

# Inicializar Earth Engine! (vamos a necesitar tener nuestro usuario habilitado)
ee_Initialize()

Adicionalmente, si tuviste algún problema durante la instalación estas funciones pueden ser útiles para comprobar el estado de las dependencias de rgee y eliminar las credenciales.

ee_check() # Verifica las dependencias que no son de R
ee_clean_credentials() # Eliminar credenciales de un usuario específico
ee_clean_pyenv() # Eliminar variables del sistema

¿Quién soy?

Yanina Bellini Saibene

Foto de Yani

Yanina Bellini Saibene, MSc. Lic. Es investigadora titular en el Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA, Argentina). Aplica sus conocimientos de informática y ciencia de datos para llevar los desarrollos tecnológicos a las regiones rurales de Argentina. Coordina la Red Nacional de Modelización de Agroecosistemas en el INTA. También desarrolla software para apoyar la investigación y la educación. Es profesora de grado y posgrado en varias universidades de Argentina y Uruguay, enseñando Ciencia de Datos aplicada y desarrollando cursos abiertos y tutoriales para enseñar habilidades técnicas en el manejo de datos. Es trainer e instructora de The Carpentries e instructora certificada de RStudio. Tambiés es miembro del Executive Council de The Carpentries y Conferences Team Lead de Forwards. Es cofundadora y miembro del Core-Team de MetaDocencia. Forma parte del equipo de R-Ladies Global, preside varias conferencias internacionales (useR! 2021, LatinR, JAIIO) y es conferencista internacional. También lidera y participa en la traducción comunitaria de material educativo y técnico al español, como Teaching Tech Together, R4DS y lecciones de The Carpentries.

yabellini.netlify.com @yabellini

Licencia

Creative Commons License
Todo el material de este curso está bajo la licencia Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Nos inspiramos y basamos en los siguientes recursos:

El código fuente de estos materiales y la página web pueden encontrarse en https://github.com/yabellini/curso_rgee.

Puedes citar ester recurso como:

Yanina Bellini Saibene. (2022). yabellini/curso_rgee: Procesando datos espaciales con R (v1.0). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.5849116